Храм в честь Иоанна Богослова находится на острове Патмос, который является частью Горного Алтая. Он расположен в Чемальском районе, на юго-западной окраине села Чемал.
История храма началась в 1849 году, когда в селе Чемал был построен первый храм, посвящённый апостолу Иоанну Богослову. В 1915 году здание было перенесено на остров Патмос, где оно простояло до 1920-х годов, пока не было разрушено.
В 2000 году благодаря усилиям московского фотохудожника В. Н. Павлова церковь Иоанна Богослова на острове Патмос была восстановлена по сохранившимся чертежам. В 2001 году храм был освящён епископом Барнаульским и Алтайским Антонием (Масендичем) и стал скитом Барнаульского Знаменского женского монастыря. А в 2013 году Иоанно-Богословский скит получил статус Архиерейского подворья епископа Горноалтайского и Чемальского.
Комплекс выполнен из кедрового дерева и включает в себя церковь для проведения служб и несколько вспомогательных помещений. Площадь храма составляет около 20 квадратных метров.
Внутри храма Иоанна Богослова расположен трёхъярусный иконостас, а среди нескольких десятков икон две считаются чудотворными.
Среди святынь храма можно выделить икону Богоматери, которая была привезена в храм в плохом состоянии, но через некоторое время начала восстанавливаться сама. А также икону «Господь Вседержитель», которая источает миро.
Чтобы добраться до храма, необходимо пройти по подвесному мосту, который находится на высоте 15 метров над бурной рекой Катунь.